番茄种子生命力的保持和种子本身的水分的含量有密切的关系，一般来说，降低种子的含水量可以延长种子寿命。根据研究，种子的含水量每下降1%,温度下降506度，则种子的寿命延长一倍。当然，番茄不同品种的种子，储藏的条件也不一样。目前，国际上通常采用的储藏方法是低温干燥贮藏法或者密封低温贮藏法。
  低温干燥贮藏法主要通过修建低温干燥的种子库 以贮藏种子，密封低温藏法是用金属玻璃等密封容器，将种子真空装罐后在低温中进行 藏。根据研究，将含水量低的番茄种子在零下4度的低温下贮藏20年，仍然有很高的成活率。一般来说，番茄种子的存放期限为4年，超过4年的种子，出苗率比较低，且出苗后长势 差，抗病虫害能力差。
  新的番茄种子，有一股腐败的番茄味，仔细观察的话，会发现其籽上有一层小茸毛。如果是陈籽，其腐败味不明显甚至完全消失，且其皮上那层小茸毛会脱落。在储备种子时要注意以下几个方面：不同品种的番茄种子要分开保存，不可混在一起；保存地点要以干燥阴凉、温度恒定为主，同时种子保存远离蒸汽、化肥、火源和农药等；计 划长期存放的种子，不要用塑料袋包装。
  对于一家一户自给自足的小规模菜园种植的番茄农户来说，保存少量种子，在储存的过程中，种子容易受潮霉变，甚至会因为保管不善被虫蛀鼠食。下面这个方法是比较适合以家 庭为单位的番茄种植户。具体方法是，将种子存放在塑料饮料瓶中，根据种子数量取大小适 中的塑料瓶，清理干净瓶内的残水，残存的水珠，连同瓶盖一起晾干。
  将种子充分晒干，趁 热装于饮料瓶中，然后将食品中常见的干燥剂一同装人瓶中，或者一根干燥的粉笔条或者木 炭条，需要用报纸包裹严实装人瓶中，主要是吸收瓶子中的潮气，将瓶盖旋紧，瓶身再贴上 外标签，存放阴凉处即可。