东京的各种电车都是有末班车的，不过他们的末班车很晚，都肯定可以送你从机场到市区。
1，Nex成田特快末班车最早，21:44发车，这是时刻表： http://www.eki-net.com/pc/jreast-shinkansen-reservation/english/wb/common/timetable/e_nex_u/08.html
2，skyliner、access特快、京成本线，基本都是22:30左右发车，这是时刻表：
http://www.keisei.co.jp/keisei/tetudou/skyliner/cn/timetable/index.html#narita1_s
3，利木津巴士，接近23:00发车，这是去东京八重洲南口的时刻表：
http://www.limousinebus.co.jp/ch1/platform_searches/index/2/11

而市内的jr更晚。所以只要能从机场进到市区内，就不必担心了。