数码宝贝如今已经出了八部动画了，幽灵游戏每周连载中，也挖了不少坑没填，以一二部为最，我这里就来列举几个。

一二部的世界观中，被选召的孩子们都是由恒常式选定的，然而恒常式自始至终没有露过庐山真面目，只有在龙狼内战时附身在嘉儿（小光）身上，而且恒常式表现极其强大，出场时瞬间震退战斗暴龙兽、钢铁加鲁鲁、木偶兽三大究极体，如此强大的实力为何会被小丑皇打的一败涂地，连进化徽章都被夺去。

同样是龙狼内战那集，恒常式提到太一和小光有不明东西，不用神圣计划也可以让数码宝贝进化，目前还不明白是什么原因，这个原因过了二十年了也没说明。

我们知道，一代大BOSS启示录兽（极恶魔王）是从从火墙的另一侧过来的，甚至有种说法，一代结局从火墙过来的那个启示录只一小部分，本体还在火墙外面，在tri中，启示录碎片又引发一阵血雨腥风。

那么火墙的另一侧到底是什么，至今未说明白。

黑暗之海既不属于数码宝贝世界又不属于人类世界，是一个完全未知的领域，这个神秘的地方首次出现于第二部第13集《达高兽的呼声》，本集制作者是克鲁苏的爱好者小中千昭，因此风格和整个数码宝贝系列完全不同，整篇的气氛都压抑灰暗，更是采用了一个不算结尾的结尾，这种诡异而未知完全就是克苏鲁神话的鲜明特征。后面可能因为太过黑暗了反响不好，所以把黑暗之海改为了黑暗的发源地。

在决战究极魔兽时，被选召的孩子将究极魔兽封印在这个神秘的黑暗之海，究极魔兽表示“你们一定会后悔”，结果这一关就是几十年。在tri最后一章结尾，黑化的玄内拿着启示录的碎片说到：“下次是究极魔兽呢？还是迪亚波罗兽？”

究极魔兽作为七大魔王之一，被吸入黑暗之海后到底如何同样没有下文。

小丑皇是黑暗四天王中唯一一个幸存者，被吸入天国之门，和究极魔兽一样生死不明。

在tri中玄内神态之癫狂、作风之诡异神似小丑，极有可能是小丑皇幻化而成，更何况小丑皇曾在玄内体内植入黑暗种子，二人极有渊源。

在一代故事发生前，黑暗四天王和四大圣兽经过长期的战斗，到被选召孩子抵达法易路岛时，四天王已经全面压制四圣兽，到了被选召孩子打败究极吸血魔兽，四天王最终完成对四圣兽的封印。到了二代，由于黑暗战斗暴龙兽破坏神圣之石，四圣兽之一的青龙兽得以解脱封印，然而白虎、玄武、朱雀三大圣兽仍旧被封印，不知道青龙兽可有营救同伴的行动。